Risalente ai primi anni del 500, è l’unica chiesa in Italia – e nel mondo – che può fregiarsi di essere dipendente della più nota San Giovanni in Laterano di Roma. La visita alla chiesa infatti consente di godere delle medesime indulgenze previste per la più nota basilica romana. Unica chiesa di rito romano in terra di rito ambrosiano, la fondazione della chiesa nella contrada Fontana è stata voluta dalle famiglie più in vista del tempo, che hanno ottenuto il permesso per la sua edificazione direttamente dal papato. All’interno, tre sculture devozionali di San Gaetano da Thiene, Sant’Antonio Abate e San Rocco, recentemente restaurate e una splendida pala d’altare dipinta dal Borgognone. Si possono ammirare anche una statua del Salvatore, tornata rocambolescamente a Villa d’Adda dopo peripezie in terre lontane e un curioso, grosso masso nella terra scavata nello spazio ricavato alle spalle della sagrestia.