La costruzione della chiesa della confraternita di San Giovanni Battista – istituita nel 1580 – risale alla seconda metà del Cinquecento ed era annessa all’Ospizio dei pellegrini. All’interno si può ammirare l’importante tela del Battesimo di Cristo (seconda metà del XVII secolo) attribuita al pittore napoletano Andrea Vaccaro (1604-1670), esempio notevole di rielaborazione della cultura visiva naturalistica del Seicento, d’ispirazione caravaggesca, in chiave accademizzante. Il dipinto ha subito un furto nell’ottobre del 1972 ed è stato ritrovato nel 1974 a Como e, quindi, ricollocato nella sua sede originaria. Nella chiesa si conserva, inoltre, la Naca settecentesca, portata in processione il venerdì santo.