La chiesa di San Paolo fu un priorato benedettino dipendente dal monastero di San Benedetto al Subasio. Venne fondato nel 1071 dall’Abate Eginaldo. Dal 1581 fu sede dell’Arte dei calzolai. Attualmente è tenuta dalla confraternita di San Rufino.
L’ingresso è sul fianco destro della chiesa. Sopra il portale è un affresco della fine del XVI sec., con i Ss. Paolo, Benedetto e Lorenzo Giustinìani attribuito al Dono Doni, ed emblemi dei monaci di S. Giorgio in Alga.